Christian Solís C., Luisa Negrón B.  

 

Facultad de Farmacia y Bioquímica–

Universidad Nacional Mayor de San Marcos. R Puno 1002 Lima 01 – Perú 

 

Resumen

 

 

   Los niveles de expresión de los miles de genes de un organismo bajo diferentes condiciones, o su evolución en el tiempo se pueden medir usando la tecnología de chips de ADN (microarrays). Para Mycobacterium tuberculosis (MT) numerosos grupos de investigación en el mundo han realizado dichos experimentos, depositando en algunos casos la información generada en base de datos de acceso libre por Internet, como GEO (Gene Expression Omnibus) del NCBI. Con el propósito de aprovechar esa información para predecir nuevos blancos farmacológicos para MT, se obtuvo información de 74 experimentos de microarrays que incluían el tratamiento de cultivos del patógeno con fármacos de uso común en la quimioterapia de la TBC (Boshoff et al, 2004), y de experimentos de microarrays que median en el tiempo la expresión génica en la micobacteria sometida a condiciones de bajo nivel de nutrientes (Hampshire et al, 2004). Dada la naturaleza de los experimentos y la cantidad de información de entrada, en el primer caso se realizo un análisis de agrupamiento fuzzy k-means, considerando como criterio para la selección de blancos farmacológicos aquellos genes que luego del análisis formaran parte de al menos 4 grupos. Para los datos de expresión génica en el tiempo se determino para cada gen el valor de entropía de Shannon, considerando para la selección de blancos farmacológicos, aquellos que presentaban un valor superior a 1.5. Estos criterios basados en el análisis de información de microarrays, usados en conjunto con otros basados en análisis de secuencias y esencialidad del gen, permitieron obtener 36 candidatos a blancos farmacológicos, de los cuáles 14 presentan similaridad de secuencia con proteínas de estructura tridimensional conocida, y 3 tienen determinadas experimentalmente sus estructuras 3D.